Classroom of the Elite

Koudo Ikusei Senior High School is een toonaangevende prestigieuze school met ultramoderne faciliteiten waar bijna 100% van de leerlingen doorstroomt naar de universiteit of een baan vindt. De leerlingen daar hebben de vrijheid om elk kapsel te dragen en persoonlijke bezittingen mee te nemen die ze maar willen. Koudo Ikusei is een paradijselijke school, maar de waarheid is dat alleen de meest superieure leerlingen een gunstige behandeling krijgen. Ayanokouji Kiyotaka is een leerling van D-klasse, waar de school zijn "inferieure" leerlingen dumpt om ze belachelijk te maken. Om een bepaalde reden was Kiyotaka onvoorzichtig tijdens zijn toelatingsexamen en werd hij in D-klasse geplaatst. Na de ontmoeting met Horikita Suzune en Kushida Kikyou, twee andere leerlingen uit zijn klas, begint de situatie van Kiyotaka te veranderen.